Sedan det första fallet av koronavirussjukdomen, i december 2019, har pandemisk sjukdom spridit sig till miljontals människor över hela världen.Denna globala pandemi av romanenallvarligt akut respiratoriskt syndrom coronavirus 2 (SARS-CoV-2)är en av de mest övertygande och oroande globala hälsokriserna i modern tid, som utgör stora hot mot världen och påverkar alla aspekter av mänskligt liv.[1]
Coronavirus är höljda, positiva, enkelsträngade RNA-virus i familjen Coronaviridae, som har ett brett spektrum av värdar som människor, fladdermöss, kameler och fågelarter, inklusive boskap och sällskapsdjur, vilket utgör ett hot mot folkhälsan. 1 Coronavirus klassificeras i underfamiljen Orthocoronavirinae, som vidare delas in i fyra släkten, baserat på skillnader i proteinsekvenser: a-coronavirus, b-coronavirus, g-coronavirus och d-coronavirus.A-coronavirus och b-coronavirus infekterar endast däggdjur, medan g-coronavirus och d-coronavirus främst infekterar fåglar, även om vissa av dem kan infektera däggdjur.HCoV-229E,
oV-OC43, HCoV-NL63, HCoV-HKU1, SARSCoV, MERS-CoV och SARS-CoV-2 är de sju koronavirus som har identifierats för att infektera människor.Bland dem är SARSCoV och MERS-CoV, som har dykt upp i den mänskliga befolkningen 2002 och 2012, högpatogena.Medan stammar av humant coronavirus (HCoV)-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43 eller HCoV-HKU1 som cirkulerar i den mänskliga befolkningen endast orsakar förkylning,7 allvarligt akut respiratoriskt syndrom coronavirus 2 (SARS-CoV2), orsaken till COVID-19, är ett nytt b-coronavirus, som dök upp tidigt i slutet av 2019 och har resulterat i förödande dödsfall.De primära symtomen påCOVID 19liknar de för SARS-CoV och MERS-CoV: feber, trötthet, torr hosta, smärta i övre bröstet, ibland diarré och dyspné.Till skillnad från tidigarecoronavirus (CoV) infektioner, den snabba globala spridningen, den höga överföringshastigheten, längre inkubationstid, mer asymtomatiska infektioner och sjukdomens svårighetsgrad av SARS-CoV-2 kräver djupgående kunskap om strategierna för virusundandragande.
Liksom andra mänskliga koronavirus (SARS-CoV-2, MERS-CoV) har SARSCoV-2 också ett enkelsträngat, positiv-sens RNA-genom på cirka 30 kb i storlek.Som visas i figur 1, buntar de virala nukleokapsid (N) proteinerna genomet till ett stort ribonukleoprotein (RNP) komplex, som sedan omsluts av lipider och virala proteiner S (spike), M (membran) och E (hölje).Genomets 50 ände har två stora öppna läsramar (ORF), ORF1a och ORF1b, som kodar för polypeptiderna pp1a och pp1b, som produceras till 16 icke-strukturella proteiner (NSP) som involverar alla aspekter av viral replikation av virala proteaser NSP3 och NSP5 som hyser en papainliknande proteasdomän respektive en 3C-liknande proteasdomän.9 Den 30 änden av genomet kodar för strukturella proteiner och accessoriska proteiner, av vilka ORF3a, ORF6, ORF7a och ORF7b har visat sig vara inblandade virala strukturella proteiner vid bildning av virala partiklar och ORF3b och ORF6 fungerar som interferonantagonister.Enligt den nuvarande anteckningen på basis av sekvenslikhet med andra b-coronavirus, inkluderar SARS-CoV-2 förutsägelser om sex accessoriska proteiner (3a, 6, 7a, 7b, 8 och 10).Men inte alla dessa ORF: er har experimentellt validerats ännu, och det exakta antalet accessoriska gener för SARS-CoV-2 är fortfarande en stridsfråga.Därför är det fortfarande oklart vilka accessoriska gener som faktiskt uttrycks av detta kompakta genom.[2]
Mycket känsliga och specifika tester är avgörande för att identifiera och hantera covid-19-patienter samt implementera kontrollåtgärder för att begränsa utbrottet.Point-of-care (POC) molekylära tester har potentialen att möjliggöra tidigare upptäckt och 2 isolering av bekräftade SARS-CoV-2-fall, jämfört med laboratoriebaserade diagnostiska metoder, och därigenom minska hushålls- och samhällsöverföring.
[1]Klinisk och operativ påverkan av snabb SARS-CoV-2-detektering på en akutmottagning
[2] Kampen mellan värd och SARS-CoV-2: Medfödd immunitet och virusundandragande strategier
Posttid: 25 maj 2022